Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBE1Q9UJT0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TUBE1Q9UJT0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms