Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
IFT172Q9UG01 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IFT172Q9UG01 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms