Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLHL13Q9P2N7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms