Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCDH10Q9P2E7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PCDH10Q9P2E7 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PCDH10Q9P2E7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCDH10Q9P2E7 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCDH10Q9P2E7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms