Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SH3BP4Q9P0V3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SH3BP4Q9P0V3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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