Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKD2L1Q9P0L9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKD2L1Q9P0L9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms