Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PDP1Q9P0J1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDP1Q9P0J1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDP1Q9P0J1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDP1Q9P0J1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDP1Q9P0J1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDP1Q9P0J1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDP1Q9P0J1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDP1Q9P0J1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PDP1Q9P0J1 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDP1Q9P0J1 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDP1Q9P0J1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDP1Q9P0J1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDP1Q9P0J1 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDP1Q9P0J1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDP1Q9P0J1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDP1Q9P0J1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDP1Q9P0J1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDP1Q9P0J1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDP1Q9P0J1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDP1Q9P0J1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDP1Q9P0J1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDP1Q9P0J1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDP1Q9P0J1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDP1Q9P0J1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDP1Q9P0J1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PDP1Q9P0J1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDP1Q9P0J1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PDP1Q9P0J1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDP1Q9P0J1 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDP1Q9P0J1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDP1Q9P0J1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDP1Q9P0J1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDP1Q9P0J1 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDP1Q9P0J1 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDP1Q9P0J1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDP1Q9P0J1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDP1Q9P0J1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDP1Q9P0J1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDP1Q9P0J1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDP1Q9P0J1 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PDP1Q9P0J1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDP1Q9P0J1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDP1Q9P0J1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDP1Q9P0J1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDP1Q9P0J1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PDP1Q9P0J1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDP1Q9P0J1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDP1Q9P0J1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDP1Q9P0J1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDP1Q9P0J1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDP1Q9P0J1 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDP1Q9P0J1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDP1Q9P0J1 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDP1Q9P0J1 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDP1Q9P0J1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDP1Q9P0J1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDP1Q9P0J1 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms