Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NKIRAS2Q9NYR9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms