Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNA2D2Q9NY47 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACNA2D2Q9NY47 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACNA2D2Q9NY47 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACNA2D2Q9NY47 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA2D2Q9NY47 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA2D2Q9NY47 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA2D2Q9NY47 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA2D2Q9NY47 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA2D2Q9NY47 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA2D2Q9NY47 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA2D2Q9NY47 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA2D2Q9NY47 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA2D2Q9NY47 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA2D2Q9NY47 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA2D2Q9NY47 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA2D2Q9NY47 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA2D2Q9NY47 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA2D2Q9NY47 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA2D2Q9NY47 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA2D2Q9NY47 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA2D2Q9NY47 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA2D2Q9NY47 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA2D2Q9NY47 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA2D2Q9NY47 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA2D2Q9NY47 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA2D2Q9NY47 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA2D2Q9NY47 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA2D2Q9NY47 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA2D2Q9NY47 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA2D2Q9NY47 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNA2D2Q9NY47 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms