Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVW2

RLIM, E3 ubiquitin-protein ligase RLIM, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLIMQ9NVW2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RLIMQ9NVW2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms