Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BIN3Q9NQY0 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms