Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ11

ATP13A2, Cation-transporting ATPase 13A2, humanhuman

Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A2Q9NQ11 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP13A2Q9NQ11 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP13A2Q9NQ11 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP13A2Q9NQ11 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP13A2Q9NQ11 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP13A2Q9NQ11 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP13A2Q9NQ11 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP13A2Q9NQ11 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP13A2Q9NQ11 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP13A2Q9NQ11 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP13A2Q9NQ11 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP13A2Q9NQ11 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP13A2Q9NQ11 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP13A2Q9NQ11 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP13A2Q9NQ11 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP13A2Q9NQ11 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP13A2Q9NQ11 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP13A2Q9NQ11 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP13A2Q9NQ11 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP13A2Q9NQ11 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP13A2Q9NQ11 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP13A2Q9NQ11 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP13A2Q9NQ11 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP13A2Q9NQ11 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP13A2Q9NQ11 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP13A2Q9NQ11 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP13A2Q9NQ11 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP13A2Q9NQ11 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP13A2Q9NQ11 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP13A2Q9NQ11 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP13A2Q9NQ11 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP13A2Q9NQ11 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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