Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB18Q9NP72 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms