Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCQ7

NPVF, Pro-FMRFamide-related neuropeptide VF, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPVFQ9HCQ7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPVFQ9HCQ7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms