Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CENPJQ9HC77 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CENPJQ9HC77 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms