Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOBEC3GQ9HC16 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms