Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6F5

CCDC86, Coiled-coil domain-containing protein 86, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC86Q9H6F5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC86Q9H6F5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC86Q9H6F5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC86Q9H6F5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC86Q9H6F5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC86Q9H6F5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC86Q9H6F5 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC86Q9H6F5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC86Q9H6F5 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC86Q9H6F5 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC86Q9H6F5 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC86Q9H6F5 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC86Q9H6F5 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC86Q9H6F5 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC86Q9H6F5 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC86Q9H6F5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC86Q9H6F5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC86Q9H6F5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC86Q9H6F5 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC86Q9H6F5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC86Q9H6F5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC86Q9H6F5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC86Q9H6F5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC86Q9H6F5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC86Q9H6F5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC86Q9H6F5 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC86Q9H6F5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC86Q9H6F5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC86Q9H6F5 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC86Q9H6F5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC86Q9H6F5 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC86Q9H6F5 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC86Q9H6F5 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC86Q9H6F5 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC86Q9H6F5 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC86Q9H6F5 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC86Q9H6F5 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC86Q9H6F5 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC86Q9H6F5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC86Q9H6F5 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC86Q9H6F5 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC86Q9H6F5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC86Q9H6F5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC86Q9H6F5 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC86Q9H6F5 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC86Q9H6F5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC86Q9H6F5 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC86Q9H6F5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC86Q9H6F5 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC86Q9H6F5 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC86Q9H6F5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC86Q9H6F5 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC86Q9H6F5 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC86Q9H6F5 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms