Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
MED28Q9H204 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MED28Q9H204 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms