Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0I3

CCDC113, Coiled-coil domain-containing protein 113, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC113Q9H0I3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC113Q9H0I3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms