Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K3

ACTR3C, Actin-related protein 3C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3CQ9C0K3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms