Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CIPCQ9C0C6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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