Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRCC1Q9C099 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRCC1Q9C099 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms