Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NMES1Q9C002 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NMES1Q9C002 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms