Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KDM5DQ9BY66 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KDM5DQ9BY66 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM5DQ9BY66 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM5DQ9BY66 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM5DQ9BY66 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM5DQ9BY66 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM5DQ9BY66 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM5DQ9BY66 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM5DQ9BY66 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM5DQ9BY66 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM5DQ9BY66 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM5DQ9BY66 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM5DQ9BY66 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM5DQ9BY66 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM5DQ9BY66 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KDM5DQ9BY66 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KDM5DQ9BY66 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KDM5DQ9BY66 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KDM5DQ9BY66 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
KDM5DQ9BY66 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KDM5DQ9BY66 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KDM5DQ9BY66 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
KDM5DQ9BY66 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
KDM5DQ9BY66 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
KDM5DQ9BY66 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
KDM5DQ9BY66 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
KDM5DQ9BY66 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
KDM5DQ9BY66 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM5DQ9BY66 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms