Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY43

CHMP4A, Charged multivesicular body protein 4a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4AQ9BY43 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHMP4AQ9BY43 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms