Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
HIGD2AQ9BW72 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms