Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVV2

FNDC11, Fibronectin type III domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC11Q9BVV2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FNDC11Q9BVV2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FNDC11Q9BVV2 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms