Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TREX2Q9BQ50 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TREX2Q9BQ50 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms