Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MEIS3Q99687 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms