Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP88Q99567 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms