Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GBP4Q96PP9 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GBP4Q96PP9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms