Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PCMTD1Q96MG8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCMTD1Q96MG8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms