Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF0

Putative uncharacterized protein LOC100506887, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q96MF0 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q96MF0 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q96MF0 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q96MF0 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q96MF0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q96MF0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q96MF0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q96MF0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q96MF0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q96MF0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q96MF0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q96MF0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q96MF0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q96MF0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q96MF0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q96MF0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q96MF0 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q96MF0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q96MF0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q96MF0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q96MF0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q96MF0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q96MF0 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q96MF0 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q96MF0 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q96MF0 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q96MF0 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q96MF0 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q96MF0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q96MF0 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q96MF0 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Q96MF0 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q96MF0 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q96MF0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q96MF0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q96MF0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q96MF0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q96MF0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q96MF0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q96MF0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q96MF0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q96MF0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q96MF0 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q96MF0 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q96MF0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q96MF0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q96MF0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q96MF0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q96MF0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q96MF0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q96MF0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q96MF0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q96MF0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q96MF0 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q96MF0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q96MF0 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q96MF0 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q96MF0 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q96MF0 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q96MF0 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q96MF0 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q96MF0 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q96MF0 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q96MF0 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q96MF0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q96MF0 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q96MF0 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q96MF0 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q96MF0 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q96MF0 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q96MF0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q96MF0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q96MF0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q96MF0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q96MF0 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q96MF0 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q96MF0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q96MF0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q96MF0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q96MF0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q96MF0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q96MF0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q96MF0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q96MF0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q96MF0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q96MF0 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q96MF0 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q96MF0 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q96MF0 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q96MF0 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q96MF0 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q96MF0 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q96MF0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q96MF0 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q96MF0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q96MF0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q96MF0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q96MF0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q96MF0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q96MF0 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms