Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX27Q96L92 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms