Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LINC00208Q96KT6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms