Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GJD4Q96KN9 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJD4Q96KN9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms