Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP47Q96K76 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP47Q96K76 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms