Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHAMP1Q96JM3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHAMP1Q96JM3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms