Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VCPIP1Q96JH7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VCPIP1Q96JH7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms