Protein–RNA interactions for Protein: Q96HA7

TONSL, Tonsoku-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TONSLQ96HA7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TONSLQ96HA7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TONSLQ96HA7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TONSLQ96HA7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TONSLQ96HA7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TONSLQ96HA7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TONSLQ96HA7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TONSLQ96HA7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TONSLQ96HA7 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TONSLQ96HA7 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TONSLQ96HA7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TONSLQ96HA7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TONSLQ96HA7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TONSLQ96HA7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TONSLQ96HA7 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TONSLQ96HA7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TONSLQ96HA7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TONSLQ96HA7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TONSLQ96HA7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TONSLQ96HA7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TONSLQ96HA7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TONSLQ96HA7 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TONSLQ96HA7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TONSLQ96HA7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TONSLQ96HA7 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TONSLQ96HA7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TONSLQ96HA7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TONSLQ96HA7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TONSLQ96HA7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TONSLQ96HA7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TONSLQ96HA7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TONSLQ96HA7 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TONSLQ96HA7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TONSLQ96HA7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TONSLQ96HA7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TONSLQ96HA7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TONSLQ96HA7 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TONSLQ96HA7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TONSLQ96HA7 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TONSLQ96HA7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TONSLQ96HA7 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TONSLQ96HA7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TONSLQ96HA7 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TONSLQ96HA7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TONSLQ96HA7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TONSLQ96HA7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TONSLQ96HA7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TONSLQ96HA7 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TONSLQ96HA7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TONSLQ96HA7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TONSLQ96HA7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TONSLQ96HA7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TONSLQ96HA7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TONSLQ96HA7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TONSLQ96HA7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TONSLQ96HA7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TONSLQ96HA7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TONSLQ96HA7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TONSLQ96HA7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TONSLQ96HA7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TONSLQ96HA7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TONSLQ96HA7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TONSLQ96HA7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TONSLQ96HA7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TONSLQ96HA7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TONSLQ96HA7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TONSLQ96HA7 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TONSLQ96HA7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TONSLQ96HA7 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TONSLQ96HA7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TONSLQ96HA7 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TONSLQ96HA7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TONSLQ96HA7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TONSLQ96HA7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TONSLQ96HA7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TONSLQ96HA7 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TONSLQ96HA7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TONSLQ96HA7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TONSLQ96HA7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TONSLQ96HA7 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TONSLQ96HA7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TONSLQ96HA7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TONSLQ96HA7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TONSLQ96HA7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TONSLQ96HA7 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TONSLQ96HA7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TONSLQ96HA7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TONSLQ96HA7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TONSLQ96HA7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TONSLQ96HA7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TONSLQ96HA7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TONSLQ96HA7 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TONSLQ96HA7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TONSLQ96HA7 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TONSLQ96HA7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TONSLQ96HA7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TONSLQ96HA7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TONSLQ96HA7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TONSLQ96HA7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TONSLQ96HA7 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms