Protein–RNA interactions for Protein: Q96EL3

MRPL53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL53Q96EL3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MRPL53Q96EL3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
MRPL53Q96EL3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPL53Q96EL3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPL53Q96EL3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPL53Q96EL3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPL53Q96EL3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPL53Q96EL3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPL53Q96EL3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPL53Q96EL3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPL53Q96EL3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPL53Q96EL3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPL53Q96EL3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPL53Q96EL3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPL53Q96EL3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPL53Q96EL3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPL53Q96EL3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPL53Q96EL3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPL53Q96EL3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPL53Q96EL3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPL53Q96EL3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPL53Q96EL3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MRPL53Q96EL3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MRPL53Q96EL3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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