Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF18Q96CE8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms