Protein–RNA interactions for Protein: Q96B26

EXOSC8, Exosome complex component RRP43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC8Q96B26 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EXOSC8Q96B26 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EXOSC8Q96B26 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
EXOSC8Q96B26 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EXOSC8Q96B26 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EXOSC8Q96B26 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EXOSC8Q96B26 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EXOSC8Q96B26 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EXOSC8Q96B26 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EXOSC8Q96B26 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EXOSC8Q96B26 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
EXOSC8Q96B26 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EXOSC8Q96B26 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
EXOSC8Q96B26 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EXOSC8Q96B26 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EXOSC8Q96B26 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EXOSC8Q96B26 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EXOSC8Q96B26 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EXOSC8Q96B26 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EXOSC8Q96B26 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EXOSC8Q96B26 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EXOSC8Q96B26 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EXOSC8Q96B26 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EXOSC8Q96B26 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EXOSC8Q96B26 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EXOSC8Q96B26 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EXOSC8Q96B26 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EXOSC8Q96B26 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EXOSC8Q96B26 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EXOSC8Q96B26 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EXOSC8Q96B26 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EXOSC8Q96B26 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EXOSC8Q96B26 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EXOSC8Q96B26 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EXOSC8Q96B26 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EXOSC8Q96B26 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EXOSC8Q96B26 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EXOSC8Q96B26 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EXOSC8Q96B26 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EXOSC8Q96B26 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EXOSC8Q96B26 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EXOSC8Q96B26 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EXOSC8Q96B26 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EXOSC8Q96B26 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EXOSC8Q96B26 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EXOSC8Q96B26 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
EXOSC8Q96B26 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
EXOSC8Q96B26 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
EXOSC8Q96B26 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EXOSC8Q96B26 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EXOSC8Q96B26 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
EXOSC8Q96B26 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EXOSC8Q96B26 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EXOSC8Q96B26 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EXOSC8Q96B26 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EXOSC8Q96B26 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EXOSC8Q96B26 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EXOSC8Q96B26 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EXOSC8Q96B26 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EXOSC8Q96B26 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EXOSC8Q96B26 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EXOSC8Q96B26 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EXOSC8Q96B26 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EXOSC8Q96B26 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EXOSC8Q96B26 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EXOSC8Q96B26 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EXOSC8Q96B26 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EXOSC8Q96B26 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EXOSC8Q96B26 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EXOSC8Q96B26 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EXOSC8Q96B26 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
EXOSC8Q96B26 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EXOSC8Q96B26 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EXOSC8Q96B26 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EXOSC8Q96B26 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EXOSC8Q96B26 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EXOSC8Q96B26 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EXOSC8Q96B26 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EXOSC8Q96B26 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EXOSC8Q96B26 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EXOSC8Q96B26 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EXOSC8Q96B26 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EXOSC8Q96B26 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EXOSC8Q96B26 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EXOSC8Q96B26 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EXOSC8Q96B26 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EXOSC8Q96B26 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EXOSC8Q96B26 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EXOSC8Q96B26 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EXOSC8Q96B26 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EXOSC8Q96B26 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EXOSC8Q96B26 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EXOSC8Q96B26 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EXOSC8Q96B26 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EXOSC8Q96B26 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EXOSC8Q96B26 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EXOSC8Q96B26 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXOSC8Q96B26 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXOSC8Q96B26 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EXOSC8Q96B26 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms