Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY2

EME1, Crossover junction endonuclease EME1, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME1Q96AY2 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EME1Q96AY2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EME1Q96AY2 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EME1Q96AY2 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EME1Q96AY2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EME1Q96AY2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
EME1Q96AY2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EME1Q96AY2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EME1Q96AY2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EME1Q96AY2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EME1Q96AY2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EME1Q96AY2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EME1Q96AY2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EME1Q96AY2 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EME1Q96AY2 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EME1Q96AY2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms