Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VTI1AQ96AJ9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VTI1AQ96AJ9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms