Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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RABGGTAQ92696 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
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RABGGTAQ92696 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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RABGGTAQ92696 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
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