Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC3

PYDC1, Pyrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYDC1Q8WXC3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PYDC1Q8WXC3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms