Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC12Q8WUD4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC12Q8WUD4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms