Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TTLL11Q8NHH1 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTLL11Q8NHH1 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TTLL11Q8NHH1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTLL11Q8NHH1 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTLL11Q8NHH1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTLL11Q8NHH1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTLL11Q8NHH1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTLL11Q8NHH1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTLL11Q8NHH1 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTLL11Q8NHH1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTLL11Q8NHH1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTLL11Q8NHH1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTLL11Q8NHH1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTLL11Q8NHH1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTLL11Q8NHH1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTLL11Q8NHH1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTLL11Q8NHH1 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTLL11Q8NHH1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTLL11Q8NHH1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTLL11Q8NHH1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTLL11Q8NHH1 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTLL11Q8NHH1 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTLL11Q8NHH1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTLL11Q8NHH1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTLL11Q8NHH1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTLL11Q8NHH1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTLL11Q8NHH1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTLL11Q8NHH1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTLL11Q8NHH1 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTLL11Q8NHH1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTLL11Q8NHH1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTLL11Q8NHH1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTLL11Q8NHH1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTLL11Q8NHH1 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTLL11Q8NHH1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTLL11Q8NHH1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTLL11Q8NHH1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTLL11Q8NHH1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTLL11Q8NHH1 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TTLL11Q8NHH1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTLL11Q8NHH1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTLL11Q8NHH1 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TTLL11Q8NHH1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTLL11Q8NHH1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTLL11Q8NHH1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTLL11Q8NHH1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTLL11Q8NHH1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TTLL11Q8NHH1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TTLL11Q8NHH1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TTLL11Q8NHH1 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TTLL11Q8NHH1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TTLL11Q8NHH1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TTLL11Q8NHH1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TTLL11Q8NHH1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTLL11Q8NHH1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms