Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SPC24Q8NBT2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPC24Q8NBT2 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
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